Aprile 25, 2024

Approfondimenti strutturali sul riconoscimento del DNA metilato da parte del dominio di legame metil-CpG di MBD6 da Arabidopsis

È interessante notare, tuttavia, che l’affinità di legame del dominio MBD AtMBD6 al DNA contenente metil-CpG è risultata significativamente inferiore a quella dei domini MBD di mammiferi noti.

La differenza principale è dovuta all’assenza di residui caricati positivamente in AtMBD6 che presumibilmente interagiscono con la spina dorsale del DNA come si vede nei complessi del DNA MBD / metil-CpG dei mammiferi. In sintesi, abbiamo gettato le basi strutturali per il riconoscimento del metil-CpG da parte di AtMBD6 per capire meglio come le proteine ​​​​MBD agiscono come mediatori dei segnali epigenetici nelle cellule vegetali.

  • I fattori di trascrizione (TF) sono proteine ​​coinvolte nella regolazione dell’espressione genica. In epigenetica è generalmente accettato che i nucleotidi metilati possano impedire al TF di legarsi ai frammenti di DNA. Tuttavia, studi recenti hanno confermato che alcuni TF hanno la capacità di interagire con frammenti di DNA metilato per regolare ulteriormente l’espressione genica.
  • Mentre gli esperimenti biochimici possono riconoscere i TF che si legano a sequenze di DNA metilato, questi metodi sperimentali umidi richiedono tempo e sono costosi. I metodi di apprendimento automatico sono una buona scelta per identificare rapidamente questi TF senza l’uso di materiali sperimentali  .
  • Pertanto, questo studio mira a progettare un robusto predittore per il rilevamento di TF associati al DNA metilato. In primo luogo, abbiamo proposto di utilizzare la funzione del vettore di parola tripeptide per formulare campioni di proteine. Quindi, sulla base di una rete neurale ricorsiva con memoria a breve termine a lungo termine, è stato progettato un modello computazionale a due stadi. Il predittore del primo passaggio è stato utilizzato per distinguere i fattori di trascrizione dai fattori di non trascrizione.
  • Una volta che le proteine ​​sono state identificate come TF, è stato utilizzato un predittore di secondo passaggio per valutare se i TF potessero legarsi al DNA metilato  . Nel test del set di dati indipendente, l’accuratezza del primo e del secondo passaggio è rispettivamente dell’86,63% e del 73,59%. Inoltre, l’analisi statistica della distribuzione dei tripeptidi nei campioni di addestramento ha mostrato che la posizione e il numero di alcuni tripeptidi nella sequenza possono influenzare il legame di TF al DNA metilato.
  • Infine, sulla base del nostro modello, è stato creato un server web gratuito basato sul modello proposto, disponibile all’indirizzo https://bioinfor.nefu.edu.cn/TFPM/

Il DNA metilato non è solo un biomarcatore diagnostico, ma anche un fattore prognostico per il cancro allo stadio iniziale.

Tuttavia, il sequenziamento del bisolfito di sodio come “gold standard” nel metodo di rilevamento dei marcatori di metilazione presenta alcuni svantaggi, come il dispendio di tempo e le procedure laboriose. Pertanto, sono necessari metodi semplici e affidabili per analizzare le sequenze di DNA con o senza residui metilati.

Qui proponiamo  un metodo semplice e diretto per rilevare la metilazione del DNA attraverso la sua transizione conformazionale al G-quadruplex utilizzando un transistor ad effetto di campo in soluzione (SG-FET) senza l’uso di materiali etichettati. Il gene   BCL-2   , che è coinvolto nello sviluppo di vari tumori umani, contiene segmenti ricchi di G e subisce un cambiamento conformazionale in un quadruplex G a seconda della concentrazione di K  +.

 

 

I filamenti G-quadruplex accumulati si muovono vicino alla superficie del sensore SG-FET, generando grandi segnali elettrici basati su cariche molecolari interne. Inoltre, una densa spazzola polimerica idrofila viene seminata dalla polimerizzazione radicalica a trasferimento di atomi avviata dalla superficie sulla superficie del sensore SG-FET per ridurre il rumore elettrico basato sull’adsorbimento non specifico di sostanze interferenti.

In particolare, il controllo dello spessore della spazzola polimerica induce segnali elettrici basati sulle cariche molecolari del DNA nello strato di diffusione, in linea con il limite di lunghezza di Debye. La piattaforma basata su sensore SG-FET con una spazzola polimerica ben definita è adatta per il  monitoraggio in situ del   DNA metilato e fornisce un dispositivo al posto letto con un elevato rapporto segnale-rumore e senza la necessità di processi aggiuntivi come la conversione del bisolfito e reazione a catena della polimerasi.

Diversi farmaci antitumorali basano la loro citotossicità sulla loro capacità di intercalare tra le coppie di basi del DNA.

  • Tuttavia, è stato stabilito che il meccanismo di intercalazione dei farmaci nel DNA inizia con un modo precedente di interazione del farmaco con il DNA che lega il solco. Occasionalmente, per alcuni tipi di piccole molecole piatte, il legame attraverso le scanalature non ha effetti citotossici ed è desiderabile che tali piccole molecole piatte entrino rapidamente nella modalità di intercalazione citotossica.
  •  È il caso dei derivati ​​fenantrolinici metilati (phen), dove i cambiamenti nella sostituzione della posizione e del numero dei gruppi metilici determinano la loro capacità di composti citotossici ed è quindi un mezzo per modulare gli effetti citotossici.
  • In questo lavoro, abbiamo studiato questa modulazione mediante l’interazione del complesso [Pt (en) (phen)]  2+   e diversi derivati ​​mediante metilazione di diversi numeri e posizioni del phe e del DNA d (GTCGAC)  2  esamero dalla   scanalatura di incollaggio utilizzando i metodi PM6-DH2 e DFT-D. L’analisi della geometria, della struttura elettronica e dell’energia dei sistemi studiati è stata confrontata con il lavoro sperimentale per ottenere informazioni sulla relazione struttura-interazione per i sistemi testati con la citotossicità.
  •  Le tendenze sono spiegate dall’indice di interazione non covalente (NCI), dall’analisi della distribuzione dell’energia (EDA) e dai contributi di solvatazione. I nostri risultati sono in linea con esperimenti in cui la metilazione della posizione 4 del phen sembra favorire l’   interazione via  legame del solco, che ostacola il passaggio alla modalità citotossica intercalare.
  • Osservando i risultati dell’NCI, queste interazioni provengono non solo dalle interazioni CH / π e CH / n del gruppo 4-metile, ma anche dal ligando etilendiammina (en), il cui orientamento nel complesso Pt è risultato produrre un gran numero di interazioni deboli con il DNA, in particolare con una spina dorsale di zucchero e fosfato

 

La metilazione della citosina è una modifica epigenetica necessaria per la formazione di eterocromatina matura, silenziamento genico e stabilità del genoma. Nelle piante, la metilazione si verifica non  solo all’interno delle basi della citosina nel CpG, ma anche nei contesti CpHpG e CpHpH, dove H è A, T o C. Proteine ​​con un dominio di legame metil-CpG (MBD) che riconoscono il gene del dinucleotide simmetrico repressori nelle cellule dei mammiferi  sono presenti anche nelle cellule vegetali, sebbene le loro proprietà strutturali e funzionali siano ancora poco conosciute.

Human Methylated DNA Control

D6255815 Biochain 5 ug 128 EUR

Mouse Methylated DNA Control

D6334149 Biochain 5 ug Ask for price

Methylamp Universal Methylated DNA Kit 

P-1011 EpiGentek
  • 684.66 EUR
  • 292.60 EUR
  • 442.20 EUR
  • 20 Modifications
  • 10 Modifications
  • 20 Modifications

DNA Damage Quantification Kit

55R-1345 Fitzgerald 25 assays 1012.8 EUR

MethylFlash Global DNA Hydroxymethylation (5-hmC) ELISA Easy Kit (Colorimetric)

P-1032 EpiGentek
  • 1067.46 EUR
  • 396.00 EUR
  • 696.30 EUR
  • 96 reactions
  • 48 reactions
  • 96 reactions

Methylamp Methylated DNA Capture (MeDIP) Kit 

P-1015 EpiGentek
  • 1050.06 EUR
  • 424.60 EUR
  • 712.80 EUR
  • 48 Reactions
  • 24 Reactions
  • 48 Reactions

FitAmp General DNA Quantification Kit 

P-1020 EpiGentek
  • 361.02 EUR
  • 126.50 EUR
  • 213.40 EUR
  • 96 Assays
  • 48 Assays
  • 96 Assays 

Monkey (Rhesus) Methylated DNA Control

D6534149 Biochain 5 ug Ask for price

DNA Quantification Assay Kit (Fluorometric)

K539-200 Biovision each 314.4 EUR

DNA Quantification Assay Kit (Fluorometric)

K539-2000 Biovision each 470.4 EUR

FitAmp Circulating DNA Quantification Kit 

P-1012 EpiGentek
  • 595.92 EUR
  • 217.80 EUR
  • 387.20 EUR
  • 96 Assays
  • 48 Assays
  • 96 Assays 

Broad Range DNA Quantification Kit, 100 assays

NS1020-BR-100 Benchmark Scientific 1 each 131.3 EUR

Methylamp Universal Methylated DNA Preparation Kit

P-1019 EpiGentek 40 µg 416.7 EUR

Monkey (Cynomolgus) Methylated DNA Control

D6534149-Cy Biochain 5 ug Ask for price

DNA Damage Quantification Colorimetric Kit

K253-25 Biovision each 732 EUR

DNA Damage Quantification Colorimetric Kit

K2100-25 ApexBio 25 assays 752.4 EUR

High Sensitivity DNA Quantification Kit, 100 assays

NS1020-HS-100 Benchmark Scientific 1 each 131.3 EUR

Library Quantification DNA Standards (S1-S6)

20-abx098897 Abbexa
  • 744.00 EUR
  • 744.00 EUR
  • 744.00 EUR
  • 744.00 EUR
  • 25%, 120 ul
  • 37.5%, 120 ul
  • 50%, 120 ul
  • 62.5%, 120 ul

EpiQuik Methylated DNA Immunoprecipitation Kit 

P-2019 EpiGentek
  • 1067.46 EUR
  • 451.00 EUR
  • 724.90 EUR
  • 48 Reactions
  • 24 Reactions
  • 48 Reactions

Fully CpG Methylated Human Genomic DNA

X10000 EpiGentek 10 µg/100 µl Ask for price

Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase

AP84971 SAB 1mg 2640 EUR

Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase

AP85149 SAB 1mg 2640 EUR

Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase

AP85431 SAB 1mg 2640 EUR

Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase

AP85584 SAB 1mg 2640 EUR

Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase

AP86064 SAB 1mg 2640 EUR

EpiQuik Tissue Methylated DNA Immunoprecipitation Kit 

P-2020 EpiGentek
  • 1067.46 EUR
  • 442.20 EUR
  • 710.60 EUR
  • 48 Reactions
  • 24 Reactions
  • 48 Reactions

Mutation Quantification Control Plasma with 50 ng spike in DNA

Z2010003 Biochain 5 ml 162 EUR

Mutation Quantification Control Plasma with 250 ng spike in DNA

Z2010004 Biochain 25 ml 540 EUR

VAHTS Library Quantification Kit for IIIumina (DNA Standards)

NQ105 Vazyme 8 rxn 432 EUR

EpiQuik 8-OHdG DNA Damage Quantification Direct Kit (Colorimetric) 

P-6003 EpiGentek
  • 1137.06 EUR
  • 486.20 EUR
  • 775.50 EUR
  • 96 Assays
  • 48 Assays
  • 96 Assays

EpiQuik 8-OHdG DNA Damage Quantification Direct Kit (Fluorometric) 

P-6004 EpiGentek
  • 1241.46 EUR
  • 500.50 EUR
  • 849.20 EUR
  • 96 Assays
  • 48 Assays
  • 96 Assays

Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase Antibody

20-abx109997 Abbexa
  • 493.20 EUR
  • 2214.00 EUR
  • 718.80 EUR
  • 218.40 EUR
  • 360.00 EUR
  • 100 ug
  • 1 mg
  • 200 ug
  • 20 ug
  • 50 ug

QuantiSir Specific Gene Knockdown Quantification Kit For DNA Damage/Repair - XRCC4

P-5003 EpiGentek 96 Assays 945.66 EUR

Methylated & Low-Methylated DNA Matched Pair - Human Lymphocyte cell line

D6254874-PP Biochain 2x5 ug 351 EUR

HDL/LDL Quantification Kit

55R-1456 Fitzgerald 100 assays 1094.4 EUR

Methylated & Low-Methylated DNA Matched Pair - Human Peripheral Blood Leukocyte

D6234148-PP Biochain 2x5 ug 351 EUR

GSSG/GSH Quantification Kit

KT-768 Kamiya Biomedical Company 200 tests 854 EUR

Cell Meterâ„¢ Colorimetric WST-8 Cell Quantification Kit

22770-1000Tests AAT Bioquest 1000 Tests 222 EUR

Cell Meterâ„¢ Colorimetric WST-8 Cell Quantification Kit

22771-5000Tests AAT Bioquest 5000 Tests 558 EUR

Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase Polyclonal Antibody

42551-100ul SAB 100ul 399.6 EUR

Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase Polyclonal Antibody

42551 SAB 100μg 390 EUR

mCherry Quantification Kit

K971-100 Biovision each 477.6 EUR

ELISA kit for Dog Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase

EK4202 SAB 96 tests 865.2 EUR

Methylated Lysine Antibody

abx448445-100ug Abbexa 100 ug 644.4 EUR

BCA Protein Quantification Kit

E112-01 Vazyme 250 rxn 158.4 EUR

BCA Protein Quantification Kit

E112-02 Vazyme 500 rxn 182.4 EUR

Free Fatty Acid Quantification Kit

55R-1455 Fitzgerald 100 assays 1012.8 EUR

Mouse IgG Quantification ELISA Kit

K4161-100 Biovision each 373.2 EUR

Dog MGMT/ Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase ELISA Kit

E0070Do Sunlong 1 Kit 860.4 EUR

ELISA kit for Human Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase

EK4201 SAB 96 tests 663.6 EUR

Rat Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase (MGMT) ELISA Kit

RK14561 Abclonal 96T 280 EUR

EpiQuik Nitrosative (8-Nitroguanine) DNA/RNA Damage Quantification Kit (Colorimetric)

P-6009 EpiGentek
  • 486.20 EUR
  • 775.50 EUR
  • 48 Assays
  • 96 Assays

Pico488 dsDNA quantification kit, 200

B1102 Lumiprobe 200 assays 382.8 EUR

Pico488 dsDNA quantification kit, 200

1102-200 Lumiprobe 200 assays 348 EUR

Human MGMT(Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase) ELISA Kit

EH2056 FN Test 96T 681.12 EUR

Human MGMT/ Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase ELISA Kit

E1588Hu Sunlong 1 Kit 685.2 EUR

Human MGMT(Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase) ELISA Kit

EKF57429-48T Biomatik Corporation 48T 396.9 EUR

Human MGMT(Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase) ELISA Kit

EKF57429-5x96T Biomatik Corporation 5x96T 2693.25 EUR

Human MGMT(Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase) ELISA Kit

EKF57429-96T Biomatik Corporation 96T 567 EUR

Mouse Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase (MGMT) ELISA Kit

RK13417 Abclonal 96T 280 EUR

Canine Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase (MGMT) ELISA Kit

RK15149 Abclonal 96T 280 EUR

Human Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase (MGMT) ELISA Kit

AE58337HU-48Tests Abebio 48 Tests 325 EUR

Human Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase (MGMT) ELISA Kit

AE58337HU-96Tests Abebio 96 Tests 610 EUR

Protein Quantification Kit (BCA Assay)

KTD3001-2500T Abbkine 2500T 169 EUR

Protein Quantification Kit (BCA Assay)

KTD3001-500T Abbkine 500 T 69 EUR

Triglyceride Quantification Kit

55R-1464 Fitzgerald 100 assays 1032 EUR

Lentivirus qPCR Quantification Kit

K1471-100 Biovision 100 Rxns 357.6 EUR

Retrovirus qPCR Quantification Kit

K1472-100 Biovision 100 Rxns 381.6 EUR

Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase Polyclonal Conjugated Antibody

C42551 SAB 100ul 476.4 EUR

Pan Methylated Lysine Antibody

abx217631-100ug Abbexa 100 ug 526.8 EUR

Methylated Lysine Antibody (APC)

abx448362-100ug Abbexa 100 ug 710.4 EUR

Methylated Lysine Antibody (RPE)

abx448404-100ug Abbexa 100 ug 710.4 EUR

Methylated Lysine Antibody (HRP)

abx448447-400ul Abbexa 400 ul 727.2 EUR

Pan Methylated Lysine Antibody

20-abx159635 Abbexa
  • 326.40 EUR
  • 276.00 EUR
  • 100 ug
  • 50 ug

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158D Stressmarq 0.1mg 434.4 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158D-A390 Stressmarq 0.1mg 490.8 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158D-A488 Stressmarq 0.1mg 489.6 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158D-A565 Stressmarq 0.1mg 489.6 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158D-A594 Stressmarq 0.1mg 489.6 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158D-A633 Stressmarq 0.1mg 489.6 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158D-A655 Stressmarq 0.1mg 489.6 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158D-A680 Stressmarq 0.1mg 489.6 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158D-A700 Stressmarq 0.1mg 489.6 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158D-ALP Stressmarq 0.1mg 483.6 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158D-APC Stressmarq 0.1mg 489.6 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158D-APCCY7 Stressmarq 0.1mg 576 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158D-DY350 Stressmarq 0.1mg 507.6 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158D-DY405 Stressmarq 0.1mg 493.2 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158D-DY488 Stressmarq 0.1mg 482.4 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158D-DY594 Stressmarq 0.1mg 484.8 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158D-DY633 Stressmarq 0.1mg 478.8 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158D-FITC Stressmarq 0.1mg 481.2 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158D-P594 Stressmarq 0.1mg 498 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158D-PCP Stressmarq 0.1mg 489.6 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158D-RPE Stressmarq 0.1mg 487.2 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158D-STR Stressmarq 0.1mg 488.4 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-158S Stressmarq 0.012mg 78 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-159F Stressmarq 0.4ml 483.6 EUR

Antibody for Methylated Lysine

SPC-160F Stressmarq 0.4ml 501.6 EUR

Pan Methylated Lysine Antibody

DF7728 Affinity Biosciences 100ul 280 EUR

Pan Methylated Lysine Antibody

DF7728-100ul Affinity Biosciences 100ul 280 EUR

Pan Methylated Lysine Antibody

DF7728-200ul Affinity Biosciences 200ul 350 EUR

Acetylcholine Quantification Kit

55R-1457 Fitzgerald 100 assays 928.8 EUR

Bradford Protein Quantification Kit

E111-01 Vazyme 500 rxn 158.4 EUR

Bradford Protein Quantification Kit

E111-02 Vazyme 1000 rxn 188.4 EUR

ELISA kit for Human Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase (MGMT)

KTE62232-48T Abbkine 48T 398.4 EUR

ELISA kit for Human Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase (MGMT)

KTE62232-5platesof96wells Abbkine 5 plates of 96 wells 2538 EUR

ELISA kit for Human Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase (MGMT)

KTE62232-96T Abbkine 96T 646.8 EUR

Methylated Lysine Antibody (FITC)

abx448376-100ug Abbexa 100 ug 693.6 EUR

Library Quantification Kit for Illumina

20-abx098895 Abbexa
  • 410.40 EUR
  • 1011.60 EUR
  • 1 ml
  • 5 ml

Library Quantification qPCR SuperMix

20-abx098896 Abbexa
  • 276.00 EUR
  • 493.20 EUR
  • 1 ml
  • 5 ml

Total Glutathione Quantification Kit

KT-767 Kamiya Biomedical Company 100 tests 532 EUR

Methylated Lysine Antibody (PerCP)

abx448396-100ug Abbexa 100 ug 710.4 EUR

Lipid Quantification Kit (Fluorometric)

STA-617 Cell Biolabs 100 assays 637.2 EUR

Methylated Lysine Antibody (Biotin)

abx448446-400ul Abbexa 400 ul 693.6 EUR

OPCA00942-100UG - Recombinant human Methylated-DNA-- protein-cysteine methyltransferase

OPCA00942-100UG Aviva Systems Biology 100ug 323 EUR

OPCA00942-20UG - Recombinant human Methylated-DNA-- protein-cysteine methyltransferase

OPCA00942-20UG Aviva Systems Biology 20ug 218 EUR

Recombinant Escherichia coli Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase (ogt)

CSB-EP013788ENV Cusabio 11689 mg Ask for price

Pan Methylated Lysine Rabbit pAb

ABD7728 Lifescience Market 100 ug 525.6 EUR

Pan Methylated Lysine Rabbit pAb

E19-7728-1 EnoGene 50ug/50ul 145 EUR

Pan Methylated Lysine Rabbit pAb

E19-7728-2 EnoGene 100ug/100ul 225 EUR

QuantiSir General Gene Knockdown Quantification Kit

P-5001 EpiGentek
  • 945.66 EUR
  • 376.20 EUR
  • 625.90 EUR
  • 96 Assays
  • 48 Assays
  • 96 Assays

Amplite® Total Sulfide Quantification Kit

21300-100Tests AAT Bioquest 100 Tests 318 EUR

Protein Quantification Kit (Bradford Assay)

KTD3002-2000T Abbkine 2000 T 89 EUR

Protein Quantification Kit (Bradford Assay)

KTD3002-5000T Abbkine 5000 T 149 EUR

Protein Quantification Kit (Bradford Assay)

KTD3002-500T Abbkine 500 T 39 EUR

VAHTS Library Quantification Kit for Illumina

NQ101 Vazyme 500 rxn 349.2 EUR

QuickQuant Mouse IgG Quantification Kit, 30 tests

QQNT-030 BioAssayWorks 30 tests 530.28 EUR

VAHTS Library Quantification Kit for Illumina

NQ101-NQ104 Vazyme 500 rxns 140 EUR

Methylated Lysine Antibody (ATTO 390)

abx448290-100ug Abbexa 100 ug 710.4 EUR

Methylated Lysine Antibody (ATTO 488)

abx448298-100ug Abbexa 100 ug 710.4 EUR

Methylated Lysine Antibody (ATTO 565)

abx448306-100ug Abbexa 100 ug 710.4 EUR

Methylated Lysine Antibody (ATTO 594)

abx448314-100ug Abbexa 100 ug 710.4 EUR

Methylated Lysine Antibody (ATTO 633)

abx448322-100ug Abbexa 100 ug 710.4 EUR

Methylated Lysine Antibody (ATTO 655)

abx448330-100ug Abbexa 100 ug 710.4 EUR

Methylated Lysine Antibody (ATTO 680)

abx448338-100ug Abbexa 100 ug 710.4 EUR

Methylated Lysine Antibody (ATTO 700)

abx448346-100ug Abbexa 100 ug 710.4 EUR

Apoptosis & Necrosis Quantification Kit (50 assays)

30017-1 Biotium KT 224 EUR

Super-Rapid Protein Quantification Kit (BCA Assay)

KTD3010-EN-500T Abbkine 500 T 89 EUR

Adeno-Associated Virus qPCR Quantification Kit

K1473-100 Biovision 100 Rxns 417.6 EUR

Pan Methylated Lysine Mouse mAb (10F8)

E2250187 EnoGene 100ul 225 EUR

Anti-Pan Methylated Lysine antibody

STJ97446 St John's Laboratory 200 µl 236.4 EUR

Methyl-beta-cyclodextrin (Mixture of Methylated)

M220100 Toronto Research Chemicals 1g 178 EUR

Methylated Lysine Antibody (Streptavidin)

abx448412-100ug Abbexa 100 ug 710.4 EUR

QuDye Protein Quantification kit (optimized for Qubit), 100

15102 Lumiprobe 100 assays 88.8 EUR

Methylated Lysine Antibody (PE / ATTO 594)

abx448388-100ug Abbexa 100 ug 727.2 EUR

Pan Methylated Lysine Blocking Peptide

DF7728-BP Affbiotech 1mg 234 EUR

Genorise® Customized PCR primers for quantification

GR108024 Genorise Scientific 2 nmol 65 EUR

Pico488 dsDNA quantification reagent, 200x solution in DMSO, 100 uL

12010 Lumiprobe 100 uL 70.8 EUR

VAHTS Library Quantification Kit for Illumina (Without ROX)

NQ102 Vazyme 500 rxn 349.2 EUR

Methylated Hesperidin (mixture of isomers)

M312097 Toronto Research Chemicals 100mg 132 EUR

Amplite® Fluorimetric Lithium Ion Quantification Kit

21351 AAT Bioquest 100Tests 505 EUR

Pan Methylated Lysine Monoclonal Antibody

EM1186-100ul ELK Biotech 100ul 334.8 EUR

Pan Methylated Lysine Monoclonal Antibody

EM1186-50ul ELK Biotech 50ul 248.4 EUR

Pan Methylated Lysine Monoclonal Antibody

HW099-100ul SAB 100ul 302.4 EUR

Pan Methylated Lysine Monoclonal Antibody

HW099-50ul SAB 50ul 224.4 EUR

Pan Methylated Lysine Monoclonal Antibody

HW099 SAB 100ul 319 EUR

VAHTS Library Quantification Kit for Illumina (Low ROX Premixed)

NQ103 Vazyme 500 rxn 349.2 EUR

EpiQuik Total Histone H3 Quantification Kit (Colorimetric) 

P-3062 EpiGentek
  • 910.86 EUR
  • 330.00 EUR
  • 599.50 EUR
  • 96 Assays
  • 48 Assays
  • 96 Assays

EpiQuik Total Histone H3 Quantification Kit (Fluorometric) 

P-3063 EpiGentek
  • 945.66 EUR
  • 333.30 EUR
  • 625.90 EUR
  • 96 Assays
  • 48 Assays
  • 96 Assays

EpiQuik Total Histone H4 Quantification Kit (Colorimetric) 

P-3072 EpiGentek
  • 910.86 EUR
  • 328.90 EUR
  • 611.60 EUR
  • 96 Assays
  • 48 Assays
  • 96 Assays

EpiQuik Total Histone H4 Quantification Kit (Fluorometric) 

P-3073 EpiGentek
  • 910.86 EUR
  • 328.90 EUR
  • 611.60 EUR
  • 96 Assays
  • 48 Assays
  • 96 Assays

Porteliteâ„¢ Fluorimetric Sodium Ion Quantification Kit

21327 AAT Bioquest 100Tests 505 EUR

Serum Triglyceride Quantification Kit (Colorimetric)

STA-396 Cell Biolabs 100 assays 706.8 EUR

Serum Triglyceride Quantification Kit (Fluorometric)

STA-397 Cell Biolabs 100 assays 706.8 EUR

VAHTS Library Quantification Kit for Illumina (High ROX Premixed)

NQ104 Vazyme 500 rxn 349.2 EUR

Sphingomyelin Quantification Colorimetric Assay Kit

K600-100 Biovision each 574.8 EUR

Porteliteâ„¢ Fluorimetric Lithium Ion Quantification Kit

21353 AAT Bioquest 100Tests 505 EUR

Per colmare questa lacuna, in questo studio abbiamo determinato la struttura della soluzione MBD6 della proteina Arabidopsis thaliana MBD6     ed abbiamo esaminato le sue proprietà di legame del DNA metilato utilizzando saggi di legame e analisi spettroscopica NMR approfondita. Il dominio MBD AtMBD6 si ripiega nella struttura MBD canonica in base alla specificità di legame del metil-CpG e ha un’interfaccia di legame del DNA simile a quella dei domini MBD dei mammiferi.

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